Nauka innov. 2012, 8(6):60–66
https://doi.org/10.15407/scin8.06.060

И.Я. Скрипкина1, А.Г. Кондратов1, Л.А. Цыба1, Г.В. Панасенко1, А.В. Николаенко1, А.М. Романенко2, Е.А. Колесник3, Д.Е. Мордерер1, К.А. Некрасов1, В.И. Кашуба1, С.А. Возианов2, И.Б. Щепотин3, А.В. Рындич1
1Институт молекулярной биологии и генетики НАН Украины, Киев
2Государственное учреждение «Институт урологии АМН Украины», Киев
3Национальный институт рака, Киев

 

Определение внеклеточной ДНК и ген-специфического метилирования в плазме крови пациентов с раком почек и толстой кишки

Раздел: Научно-технические инновационные проекты  Национальной академии наук Украины
Язык статьи: украинский
Аннотация: Статус метилирования некоторых генов и уровень концентрации внеклеточной ДНК (вкДНК) крови является важным диагностическим критерием, связанным с возникновением злокачественных опухолей. В результате проведенных исследований нами показано, что уровень вкДНК в крови пациентов с раком почек и толстой кишки выше, чем у здоровых доноров. Метилирование CpG-островков генов LRRC3B, APC и FHIT было обнаружено у 33,3; 27,8 и 33,3 % пациентов с раком почек и у 14,3; 28,5 и 19 % пациентов с раком толстой кишки соответственно. У здоровых доноров метилирование исследованных генов обнаружено не было. Предложено методики для количественной оценки вкДНК в плазме крови и анализа метилирования маркерных генов с целью обнаружения нарушений в организме человека, связанных с развитием онкологических болезней.
Ключевые слова: внеклеточная ДНК плазмы крови, рак почки, рак толстой кишки, метил-специфическая ПЦР, гены-маркеры злокачественных опухолей.

Полный текст (PDF)

Литература:
1. Garcia J.A., Rini B.I. Recent progress in the management of advanced renal cell carcinoma . C.A. Cancer. J. Clin.  2007.  V. 57, No. 2.  P. 112125.
2. Rynditch A., Pekarsky Y., Schnittger S. et al. Leukemia breakpoint region in 3q21 is gene rich . Gene.  1997. V. 193, No. 1.  P. 4957.
3. Pekarsky Y., Rynditch A., Wieser R. et al. Activation of a novel gene in 3q21 and identification of intergenic transcripts with EVI1 in leukaemia . Cancer. Research. 1997.  V. 57, No. 18.  Р. 39143919.
4. Кашуба В.И., Скрипкина И.Я., Сараев Д.В. и др. Использование NotI-микрочипов для идентификации изменений в локусах генов, потенциально участвующих в развитии рака шейки матки . Ukr. Biokhim. Zh.  2006.  Т. 78, No. 2.  С. 4956.
5. Скрипкіна І.Я., Кашуба В.І., Гордиюк В.В. та ін. Ідентифікація змін в локусах генів, які потенційно задіяні в розвитку раку нирок, за допомогою нової технології NotI-мікрочипів . Доповіді академії наук України.  2006.  No. 11.  С. 188192.
6. Gerashchenko G.V., Gordiyuk V.V., Skrypkina I.Y. et al. Screening of epigenetic and genetic disturbances of human chromosome 3 genes in colorectal cancer . Ukr.Bio khim. Zh.  2009.  V. 81, No. 4.  Р. 8187.
7. Leon S.A., Shapiro B., Sklaroff D.M. and Yaros M.J. Free DNA in the serum of cancer patients and the effect of therapy . Cancer Res.  1977.  V. 37, No. 3.  P. 646650.
8. Chang H.W., Goodman S.N., Singer G. et al. Assessment of plasma DNA levels, allelic imbalance, and CA 125 as dia g nostic tests for cancer . J Natl. Cancer Inst. 2002.  V. 94.  P. 16971703.
9. Ellinger J., Bastian P.J., Haan K.I. et al. Noncancerous PTGS2 DNA fragments of apoptotic origin in sera of prostate cancer patients qualify as diagnostic and prognostic indicators . Int J Cancer.  2008.  V. 122, No. 1. P. 138143.
10. Jung K., Fleischhacker M., Rabien A. Cell-free DNA in the blood as a solid tumor biomarker  A critical appraisal of the literature . Clinica. Chimica. Acta.  2010.  V. 411.  P. 16111624.
11. Fleischhacker M., Schmidt B. Circulating nucleic acids (CNAs) and cancer  A survey . Biochimica et Biophy sica Acta.  2007.  V. 1775.  P. 181232.
12. Vlassov V.V., Laktionov P.P., Rykova E.Y. Circulating nucleic acids as a potential source for cancer biomarkers . Curr. Mol. Med.  2010.  V. 10.  P. 142165.
13. Schwarzenbach H., Hoon D.S., Pantel K. Cell-free nucleic acids as biomarkers in cancer patients . Nat. Rev. Cancer.  2011.  V. 11, No. 6.  P. 426437.
14. Czeiger D., Shaked G., Eini H. et al. Measurement of circulating cell-free DNA levels by a new simple fluorescent test in patients with primary colorectal cancer . Am. J. Clin. Pathol.  2011.  V. 135, No. 22.  P. 6470.
15. Martino M., de Klatte T., Haitel A. and Marberger M. Serum cell-free DNA in renal cell carcinoma: a diagnostic and prognostic marker . Cancer.  2012.  V. 18, No. 1. P. 8290.
16. Hauser S., Zahalka T., Ellinger J. et al. Cell-free Circulating DNA: Diagnostic Value in Patients with Renal Cell Cancer . Anticancer Research.  2010.  V. 30. P. 27852790.
17. Tian X.Q., Zhang Y., Sun D. et al. Epigenetic silencing of LRRC3B in colorectal cancer . Scand J Gastroenterol. 2009.  V. 44, No. 1.  P. 7984.
18. Kim M., Kim J.H., Jang H.R. et al. LRRC3B, encoding a leucine-rich repeat-containing protein, is a putative tumor suppressor gene in gastric cancer . Cancer Res. 2008.  V. 68, No. 17.  P. 71477155.
19. Kondratov A.G., Stoliar L.A., Kvasha S.M. et al. Methylation pattern of the putative tumor-suppressor gene LRRC3B promoter in clear cell renal cell carcinomas . Mol. Med. Report.  2012.  V. 5, No. 2.  P. 509512.
20. Pekarsky Y., Garrison P.N., Palamarchuk A. et al. Fhit is a physiological target of the protein kinase . Src. Proc Natl Acad. Sci. USA.  2004.  V. 101, No. 11.  P. 37753779.
21. Kvasha S., Gordiyuk V., Kondratov A. et al. Hyper methyla tion of the 5’CpG island of the FHIT gene in clear cell renal carcinomas . Cancer Lett.  2008.  V. 265, No. 2. P. 250257.
22. Brock M.V., Hooker C.M., Ota-Machida E. et al. DNA methylation markers and early recurrence in stage I lung cancer . N. Engl. J. Med.  2008.  V. 358, No. 11.  P. 11181128.
23. Rowan A.J., Lamlum H., Ilyas M. et al. APC mutations in sporadic colorectal tumors: A mutational «hotspot» and interdependence of the «two hits» . Proc. Natl. Acad. Sci. USA.  2000.  V. 97, No. 7.  P. 33523357.